86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1168 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1168  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3163  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  95.09 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000280398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1079  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  69.51 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3140  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  68.81 
 
 		 225 aa  322  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1371  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  68.81 
 
 		 225 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  68.81 
 
 		 225 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3502  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.51 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2977  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.22 
 
 		 224 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0579  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  53.18 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2444  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  48.64 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.54345  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2376  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  47.3 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002796  D,D-carboxypeptidase-related protein  46.26 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03184  hypothetical protein  47.14 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1735  VanY family protein  44.69 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3368  putative D,D-carboxypeptidase-related protein  43.84 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0527224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2193  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  42.53 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1429  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.22 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1764  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  42.86 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3180  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  40.81 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02545  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  40 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.457217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1861  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.33 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2187  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.95 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222762  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2472  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  37.75 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1856  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  38.92 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1911  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  38.42 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.494098  hitchhiker  0.0000706495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1646  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  43.15 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.806668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2122  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  37.93 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.737189  hitchhiker  0.000240208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1813  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  45.09 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.877549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2419  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  35 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  decreased coverage  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1991  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.01 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  hitchhiker  0.0000000547334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2355  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.59 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0293083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2368  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.95 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2471  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.95 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  0.0767721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2124  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.47 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1990  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.9 
 
 		 192 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09648  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.64 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.538817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.09 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.02 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.7 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.09 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.09 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.48 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.22 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.75 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.12 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.37 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.37 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.82 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.6 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.37 
 
 		 281 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.6 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.6 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.57 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.57 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.57 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.22 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.19 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.19 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1102  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.32 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.19 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.43 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.92 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.43 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2250  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.66 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.33 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  29.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.68 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.52 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4758  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.81 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  26.43 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  22.81 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.71 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>