More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1010 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  100 
 
 		 312 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  95.19 
 
 		 312 aa  607  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  78.14 
 
 		 311 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  76.61 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  72.41 
 
 		 312 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  68.18 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  68.53 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  68.53 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  57.04 
 
 		 319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  55.79 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  54.93 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  55.44 
 
 		 323 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  53.87 
 
 		 323 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  54.23 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  54.23 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  54.23 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  54.23 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  54.58 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  53.87 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  53.87 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  53.87 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  53.87 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  53.17 
 
 		 323 aa  338  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  53.52 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  53.17 
 
 		 323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  53.17 
 
 		 323 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  53.52 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  53.33 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  54.98 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  53.33 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  52.96 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  50.96 
 
 		 322 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  52.98 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  53.33 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  55.28 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  53.33 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  49.69 
 
 		 319 aa  324  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  54.58 
 
 		 322 aa  324  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  54.01 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  52.11 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  53.33 
 
 		 332 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  52.46 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  52.11 
 
 		 325 aa  315  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  49.65 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  52.5 
 
 		 322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  50.18 
 
 		 323 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  49.3 
 
 		 319 aa  298  9e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  53.09 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  50.36 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  51.62 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  50 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  45.99 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  47.2 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  32.77 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.46 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.97 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.46 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  30.83 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.85 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  28.95 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  30.9 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  32.44 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.03 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  31.11 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.39 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.43 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.87 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  29.33 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  30.55 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  28.04 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  27.31 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  29 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  25.26 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.2 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.09 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.28 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.66 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  27.88 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.38 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  29.54 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.09 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  24.63 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  27.18 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  26.62 
 
 		 267 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  30.35 
 
 		 264 aa  96.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  22.07 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  28.83 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.74 
 
 		 272 aa  95.9  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  28.98 
 
 		 558 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  27.34 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  26.8 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  27.21 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.59 
 
 		 218 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  27.36 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>