62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0690 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  96.43 
 
 		 336 aa  596  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  80.65 
 
 		 336 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  81.25 
 
 		 336 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  50.6 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  53.51 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  50.91 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  51.21 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  51.21 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  51.21 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  52.68 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  44.13 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  43.38 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  44.34 
 
 		 341 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  39.82 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  39.82 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  41.78 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  41.44 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  42.71 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  41.1 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  41.1 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  41.1 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  42.03 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  42.03 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  41.69 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  41.69 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  42.07 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  40.27 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  41.47 
 
 		 351 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  42.12 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  42.12 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  42.12 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  42.12 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  42.12 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  41.78 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  41.78 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  42.03 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  41.73 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  39.53 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  42.53 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  36.89 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  40.88 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  35.92 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  42.42 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  41.55 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  33.63 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  39.23 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  32.46 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  42.92 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  42.92 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  33.57 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  34.29 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  33.57 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  30.9 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  33.68 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.43 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  23.42 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  23.42 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  26.42 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>