More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_45190  putative glycerol kinase  100 
 
 
471 aa  948    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0889637  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1680  carbohydrate kinase, FGGY  65.74 
 
 
484 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.450343  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2692  carbohydrate kinase FGGY  51.36 
 
 
480 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0288488  hitchhiker  0.00183322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  38.1 
 
 
510 aa  317  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  37.5 
 
 
513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  36.71 
 
 
513 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  34.17 
 
 
479 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  36.45 
 
 
510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  37.6 
 
 
520 aa  309  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  34.89 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  36.83 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  34.89 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  36.66 
 
 
513 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  35.69 
 
 
507 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  39.07 
 
 
498 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  38.68 
 
 
504 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  35.98 
 
 
527 aa  293  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  41.31 
 
 
495 aa  293  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1657  glycerol kinase  38.98 
 
 
510 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1188  glycerol kinase  35.37 
 
 
500 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  37.4 
 
 
505 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  36.59 
 
 
505 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  39.51 
 
 
497 aa  290  3e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  33.94 
 
 
497 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0218  glycerol kinase  34.27 
 
 
505 aa  290  4e-77  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  34.29 
 
 
494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  38.29 
 
 
496 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1215  glycerol kinase  35.16 
 
 
500 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  35.25 
 
 
489 aa  288  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  34.35 
 
 
494 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  39.07 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  38.74 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  33.67 
 
 
496 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  38.85 
 
 
492 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  33.87 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  33.87 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  33.87 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  36.97 
 
 
498 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  36.69 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  37.4 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  36.65 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  35.35 
 
 
499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  33.87 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  33.87 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  33.87 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  33.67 
 
 
496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  36.4 
 
 
501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  32.66 
 
 
500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  34.15 
 
 
498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  37.27 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  32.39 
 
 
499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  37.7 
 
 
494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  36.71 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  37.12 
 
 
495 aa  283  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  34.7 
 
 
500 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  39.17 
 
 
502 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  36.23 
 
 
500 aa  283  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  33.81 
 
 
502 aa  282  9e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  39.01 
 
 
495 aa  282  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3101  glycerol kinase  37.37 
 
 
493 aa  282  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  33.47 
 
 
496 aa  282  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  34.15 
 
 
498 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  39.78 
 
 
502 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  35.63 
 
 
516 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  33.6 
 
 
501 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  36.03 
 
 
503 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  35.92 
 
 
494 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  38.69 
 
 
499 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  35.01 
 
 
505 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  36.23 
 
 
510 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  35.99 
 
 
494 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  38.26 
 
 
494 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  36.86 
 
 
496 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  34.29 
 
 
499 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  35.99 
 
 
494 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  34.89 
 
 
505 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  35.71 
 
 
494 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  35.99 
 
 
494 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  36.97 
 
 
509 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  32.25 
 
 
500 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  35.51 
 
 
494 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  38.22 
 
 
492 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  34.5 
 
 
499 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  36.21 
 
 
498 aa  279  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1940  glycerol kinase  38.1 
 
 
483 aa  279  8e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  34.29 
 
 
499 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  35.79 
 
 
494 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  35.14 
 
 
514 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  33.68 
 
 
501 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  33.74 
 
 
500 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  36.38 
 
 
496 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  36.55 
 
 
483 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  37.08 
 
 
498 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  35.17 
 
 
494 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  36.81 
 
 
484 aa  276  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  36.85 
 
 
498 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0084  glycerol kinase  37.73 
 
 
489 aa  276  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  35.29 
 
 
497 aa  276  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  35.41 
 
 
510 aa  276  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  35.38 
 
 
494 aa  275  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>