56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12381 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  64.18 
 
 
288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  56.27 
 
 
280 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  59.42 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  54.64 
 
 
280 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  54.29 
 
 
280 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  48.58 
 
 
289 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  50.74 
 
 
289 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  50.74 
 
 
289 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.4 
 
 
289 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  39.41 
 
 
285 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  39.41 
 
 
285 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  41.95 
 
 
295 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  38.66 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 
290 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  26.89 
 
 
320 aa  55.8  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  28.92 
 
 
300 aa  55.8  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  23.51 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  29.93 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  26.19 
 
 
304 aa  52.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  24.48 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  25.94 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  26.8 
 
 
304 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  21.74 
 
 
306 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 
305 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  31.19 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.86 
 
 
345 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.84 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.67 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  29.74 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  26.36 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  25.88 
 
 
323 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  28.4 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  26.26 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  23.47 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  25.26 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  23.36 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  25.86 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  24.84 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  37.97 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  27.15 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  37.84 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  37.5 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  32.43 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  37.84 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  23.77 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  28.68 
 
 
332 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  45.61 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  26.48 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  21.96 
 
 
305 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  26.67 
 
 
338 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  29.57 
 
 
387 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  24.66 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  33.8 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>