More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18631 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  98.68 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  98.01 
 
 
151 aa  298  3e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  84.11 
 
 
151 aa  266  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  72.19 
 
 
152 aa  226  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  70.86 
 
 
152 aa  221  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  70.47 
 
 
152 aa  219  8e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  68.87 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  71.9 
 
 
152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  71.24 
 
 
152 aa  217  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 
152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 
152 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  56.38 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 
152 aa  154  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 
152 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  50.99 
 
 
152 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
159 aa  103  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.87 
 
 
148 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  38.51 
 
 
195 aa  100  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  38.16 
 
 
150 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.07 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.81 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.25 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  41.45 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  39.07 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  37.32 
 
 
151 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  36.6 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  35.33 
 
 
149 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  41.5 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  40.13 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.76 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  34.87 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  38.67 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  33.56 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
209 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  31.08 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  33.56 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.48 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  36.18 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  84.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
188 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  34.39 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
151 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
149 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  34.19 
 
 
150 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.18 
 
 
149 aa  84  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
189 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>