72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15721 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
171 aa  335  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  73.1 
 
 
172 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  70.83 
 
 
170 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  70.83 
 
 
170 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  61.96 
 
 
170 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  61.96 
 
 
170 aa  207  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  61.35 
 
 
170 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  60.74 
 
 
170 aa  203  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  59.35 
 
 
160 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  56.13 
 
 
160 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  38.98 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  39.18 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  38.98 
 
 
178 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  39.88 
 
 
180 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  36.72 
 
 
179 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  38.51 
 
 
177 aa  90.5  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.22 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.35 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.64 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
181 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 
162 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  35.34 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.9 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.88 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  26.85 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  24.2 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  24.2 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.39 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  26.28 
 
 
448 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.94 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  28.79 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.41 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  32.41 
 
 
188 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.79 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.79 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.53 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25.79 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.06 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.47 
 
 
185 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.16 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.47 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>