64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4343 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 346 aa  708    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  31.37 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  27.9 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  29.75 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  25.66 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  26.24 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  26.92 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  23.74 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4307  transcriptional regulator, LacI family  29.58 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.19442  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  22.12 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  26.26 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  22.78 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  45.28 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  23.15 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  24.84 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  29.06 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  23.68 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05070  putative LacI-family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.697537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  23.5 
 
 		 339 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  19.39 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.37 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6639  transcriptional regulator, LacI family  22.89 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0194  LacI family transcription regulator  24.87 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  23.36 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  25.37 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.54 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  25.95 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  45.45 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  25.16 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1615  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.16 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  21.72 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  43.64 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0032  Alanine racemase  31.16 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.0639211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  21.08 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  22.94 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  25.26 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  27.78 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.37 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  21.24 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  23 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2760  transcriptional regulator, LacI family  45.83 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  25.35 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  21.33 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  24.06 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6824  transcriptional regulator, LacI family  48.84 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  22.27 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>