More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3999 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3999  ribonuclease III  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329271  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4279  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3414  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 
306 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1293  ribonuclease III  40.26 
 
 
323 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0291  glycosyl transferase family 2  40.58 
 
 
312 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0939  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
317 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3309  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
317 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14340  glycosyl transferase  39.03 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.049035  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14420  glycosyl transferase  38.57 
 
 
297 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0725  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.367599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3259  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
320 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
340 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3121  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
315 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0465511  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.36 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.51 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.51 
 
 
322 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  31.51 
 
 
322 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
322 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.51 
 
 
322 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.51 
 
 
322 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  31.51 
 
 
322 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.51 
 
 
322 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.92 
 
 
327 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.92 
 
 
327 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.92 
 
 
327 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
320 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
327 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.92 
 
 
327 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.92 
 
 
327 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.77 
 
 
327 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.77 
 
 
327 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
320 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
312 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  31.55 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.39 
 
 
323 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.39 
 
 
323 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.39 
 
 
323 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  29.39 
 
 
323 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
326 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
324 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.07 
 
 
323 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
341 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
320 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
351 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6493  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
335 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  31.13 
 
 
339 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
321 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.43 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  32.29 
 
 
347 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.75 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
334 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
309 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  30.55 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
336 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
331 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  27.83 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
347 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  28.57 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
366 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  28.16 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  30.79 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  28.48 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  27.83 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  28.48 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  26.98 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  30.06 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.68 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
349 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
344 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.43 
 
 
331 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
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NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
335 aa  125  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  28.62 
 
 
306 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
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NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
320 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
319 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
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NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 
335 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 
335 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
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