66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2076 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
326 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  32.41 
 
 
338 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2956  Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly-like protein  32.46 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  29.8 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  29.8 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  28.44 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  24.3 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  21.98 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  28.23 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  21.98 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  26.17 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  24.62 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  24.62 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  24.62 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  27.11 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  23.25 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  24.38 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.15 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  25.15 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.87 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  22.93 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  22.93 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  24.4 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  22.93 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  22.93 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  23.82 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  37.11 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  38.95 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.49 
 
 
363 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  35.94 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  25.81 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  24.45 
 
 
368 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  36.22 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  36.22 
 
 
308 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  25 
 
 
339 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  29.86 
 
 
326 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.49 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  37.3 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  24.15 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  34.02 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  40.85 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.05 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  25.71 
 
 
622 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  33.66 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  24.26 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  23.65 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  23.15 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.56 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  22.22 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.2 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  29.66 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  21.6 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  33.03 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  32 
 
 
337 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  37.63 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  25.25 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  26.42 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.76 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  39.56 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  25.47 
 
 
362 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  28.51 
 
 
339 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>