40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1173 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1173  cupin 2, barrel  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.53 
 
 		 190 aa  160  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0494283  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2653  cupin 2, barrel  51.16 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  48.41 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0255611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3434  cupin 2, conserved barrel  43.68 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33880  Twin-arginine translocation pathway signal and cupin region containing protein  49.13 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.598142  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  48.52 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8014  hypothetical protein  45.22 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2965  hypothetical protein  42.6 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4405  hypothetical protein  45.61 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1469  hypothetical protein  43.6 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2437  double-stranded beta helix domain-containing protein  45.12 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405943  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1284  hypothetical protein  42.17 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0958  double-stranded beta helix domain-containing protein  43.11 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4232  cupin 2, barrel  41.82 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2571  cupin 2, barrel  37.22 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3600  cupin domain-containing protein  39.49 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.694077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1308  hypothetical protein  39.62 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0546028  normal  0.184084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5300  hypothetical protein  40.88 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  44.06 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3548  hypothetical protein  41.33 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02784  conserved hypothetical protein  35.56 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01020  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00090  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09281  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  34.83 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  37.7 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  37.7 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  37.7 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  37.7 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 110 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  37.7 
 
 		 110 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  37.7 
 
 		 110 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  37.7 
 
 		 110 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  32.18 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  37.7 
 
 		 110 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>