More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0876 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0876  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
294 aa  596  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.67 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  43.1 
 
 
290 aa  217  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.41 
 
 
287 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.12 
 
 
287 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  41.06 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.66 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
287 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
287 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
287 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
287 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
287 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
287 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 
282 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.94 
 
 
289 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.22 
 
 
287 aa  208  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.33 
 
 
291 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  39.33 
 
 
285 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
291 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
288 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
286 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 
286 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
288 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.76 
 
 
287 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
287 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
286 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 
291 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  42.42 
 
 
291 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
283 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.45 
 
 
290 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.33 
 
 
286 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
286 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
293 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
288 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
286 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
291 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
291 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
287 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.07 
 
 
288 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.67 
 
 
286 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
286 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  40.88 
 
 
286 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
286 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
286 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  38.74 
 
 
287 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
286 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
286 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41 
 
 
290 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  39.19 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.86 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.46 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.18 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
286 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  40 
 
 
291 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
288 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
286 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  38.49 
 
 
295 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 
298 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
288 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.33 
 
 
286 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
281 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.25 
 
 
289 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  42.76 
 
 
287 aa  198  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.39 
 
 
295 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.82 
 
 
287 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.82 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.39 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.18 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>