45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3609 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.64 
 
 
239 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  45.15 
 
 
236 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.4 
 
 
245 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  43.15 
 
 
262 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.1 
 
 
246 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.08 
 
 
248 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.77 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.08 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  43.33 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.25 
 
 
248 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  42.17 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  41.53 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  42.45 
 
 
268 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.11 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.68 
 
 
246 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  42.17 
 
 
263 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  42.17 
 
 
263 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.17 
 
 
246 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  43.33 
 
 
238 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.48 
 
 
238 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.79 
 
 
251 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  39.41 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  47.34 
 
 
252 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.31 
 
 
217 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  37.97 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  36.89 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  29.24 
 
 
255 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  34.95 
 
 
242 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  34.81 
 
 
242 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  38.15 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  36.02 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  30.73 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  33.54 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.82 
 
 
755 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  27.5 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.47 
 
 
217 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  29.61 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  28.14 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  26.24 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3000  hypothetical protein  24.15 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.117873  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  27.38 
 
 
216 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  28.09 
 
 
200 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>