24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3000 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.117873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3543  hypothetical protein  73.56 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  55.45 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0110  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  36.65 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1802  hypothetical protein  28.41 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000113595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 		 755 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  25.21 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.64 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  24.15 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.62 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  34.09 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  34.09 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  23.01 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  23.01 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  25.94 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  25.98 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  29.67 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  22.52 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  25.37 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.34 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  21.28 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  23.58 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.22 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>