More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2577 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  84.39 
 
 
205 aa  345  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  83.9 
 
 
205 aa  342  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.73 
 
 
223 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.73 
 
 
223 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  69.52 
 
 
229 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  70.59 
 
 
220 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.64 
 
 
203 aa  232  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.54 
 
 
236 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
215 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.59 
 
 
199 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.19 
 
 
209 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.41 
 
 
224 aa  201  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.94 
 
 
212 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.63 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.13 
 
 
220 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.79 
 
 
198 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.59 
 
 
194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.05 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.2 
 
 
209 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.05 
 
 
192 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.81 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.72 
 
 
198 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.3 
 
 
219 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
216 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
221 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.99 
 
 
213 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.75 
 
 
219 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.17 
 
 
219 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.28 
 
 
216 aa  191  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
220 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.63 
 
 
220 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.15 
 
 
220 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.97 
 
 
214 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
217 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.13 
 
 
218 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
220 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
220 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.06 
 
 
206 aa  188  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
192 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
218 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.91 
 
 
222 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.44 
 
 
197 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.65 
 
 
220 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 
205 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.28 
 
 
209 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
222 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.45 
 
 
221 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
217 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.4 
 
 
212 aa  184  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
210 aa  184  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.01 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.39 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.09 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.24 
 
 
216 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.76 
 
 
198 aa  181  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.2 
 
 
216 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.14 
 
 
200 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.56 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.74 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.76 
 
 
196 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.49 
 
 
211 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.99 
 
 
215 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.03 
 
 
205 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
217 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.19 
 
 
213 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.48 
 
 
193 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
197 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  45.41 
 
 
212 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
212 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
195 aa  174  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
197 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.9 
 
 
212 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.32 
 
 
218 aa  174  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.45 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3067  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.3 
 
 
196 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.52 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.11 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.97 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.86 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  45.26 
 
 
186 aa  171  5e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.36 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.36 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>