79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33009 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_33009  predicted protein  100 
 
 
895 aa  1854    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.534008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  25.17 
 
 
314 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  25.17 
 
 
314 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  31.86 
 
 
299 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  28.66 
 
 
310 aa  58.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  29.63 
 
 
305 aa  58.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  25.19 
 
 
299 aa  58.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6486  predicted protein  33.33 
 
 
98 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.631155  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  23.01 
 
 
287 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  37.8 
 
 
296 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.47 
 
 
315 aa  56.2  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  55.5  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  34.18 
 
 
308 aa  54.7  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  31.71 
 
 
308 aa  54.7  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46385  predicted protein  25.97 
 
 
476 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  23.78 
 
 
307 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  23.69 
 
 
300 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  37.21 
 
 
305 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  32.91 
 
 
321 aa  53.5  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  23.27 
 
 
425 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1864  hypothetical protein  38.24 
 
 
92 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  24.84 
 
 
309 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  30.15 
 
 
303 aa  52  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  30.86 
 
 
299 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  30.86 
 
 
299 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  30.86 
 
 
299 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  30.38 
 
 
299 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  33.75 
 
 
306 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  23.87 
 
 
309 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  21.61 
 
 
305 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  25.54 
 
 
308 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  24.18 
 
 
307 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  25.87 
 
 
303 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  33.77 
 
 
304 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  32.26 
 
 
306 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  23.33 
 
 
298 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  21.3 
 
 
327 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  28.42 
 
 
300 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  29.27 
 
 
307 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  26.1 
 
 
321 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  24.54 
 
 
315 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 
390 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  19.44 
 
 
321 aa  48.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  22.3 
 
 
310 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  25.23 
 
 
306 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  30.26 
 
 
314 aa  47.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  19.1 
 
 
321 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  22.03 
 
 
300 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  19.1 
 
 
304 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29867  predicted protein  29.55 
 
 
354 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.953466  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  26.92 
 
 
499 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  19.1 
 
 
304 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  19.1 
 
 
304 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  19.1 
 
 
304 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  19.1 
 
 
321 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  22.27 
 
 
310 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  19.1 
 
 
304 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  25.37 
 
 
295 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  21.43 
 
 
303 aa  47  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  19.1 
 
 
304 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  21.45 
 
 
306 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  25.45 
 
 
302 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  21.57 
 
 
315 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  35.14 
 
 
306 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  24.18 
 
 
297 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  35.14 
 
 
306 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  26.19 
 
 
295 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  25.68 
 
 
333 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  24.22 
 
 
307 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  25.17 
 
 
302 aa  44.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  24.42 
 
 
297 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  30.49 
 
 
291 aa  45.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  27.78 
 
 
304 aa  44.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  29.52 
 
 
272 aa  44.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06750  conserved hypothetical protein  22.7 
 
 
639 aa  44.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  26.01 
 
 
315 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  20.69 
 
 
305 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  24.42 
 
 
323 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  26.42 
 
 
306 aa  44.3  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>