89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3060 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_3060  predicted protein  100 
 
 
346 aa  716    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.206644  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  33.92 
 
 
368 aa  172  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  33.53 
 
 
503 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32290  predicted protein  36.36 
 
 
684 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  30.1 
 
 
832 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56782  predicted protein  25.78 
 
 
628 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04070  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 
811 aa  90.9  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.96924  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01200  expressed protein  23.86 
 
 
758 aa  77  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  26.25 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  23.37 
 
 
556 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
552 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  26.14 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40815  predicted protein  35.37 
 
 
182 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533421  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  24.92 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0667  metallo-beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 
596 aa  55.5  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00731629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  22.71 
 
 
556 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  24.34 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17702  predicted protein  22.53 
 
 
411 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.257016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
556 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
590 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 
555 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  34.15 
 
 
547 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  22.8 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 
555 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  27.17 
 
 
631 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  23.38 
 
 
555 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 
555 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  21.77 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 
553 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  21.66 
 
 
583 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  20.96 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  29.52 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  23.25 
 
 
555 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  23.81 
 
 
558 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  28.15 
 
 
644 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  22.61 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  25.74 
 
 
813 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  23.25 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  23.8 
 
 
551 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
561 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  23.27 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  23.12 
 
 
555 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
554 aa  46.6  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
560 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  28.57 
 
 
383 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  25.25 
 
 
351 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  21.68 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  22.04 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
557 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1169  conserved hypothetical protein  21.61 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.561924  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  32.52 
 
 
563 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1846  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
422 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  25.08 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 
553 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 
555 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  20.51 
 
 
618 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
557 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  29.48 
 
 
767 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2889  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
549 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3231  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
549 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 
557 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.99 
 
 
578 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  22.19 
 
 
566 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  22.61 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.9 
 
 
1017 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  22.32 
 
 
555 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  30 
 
 
565 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
557 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4880  Beta-lactamase-like  26.99 
 
 
555 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419128  hitchhiker  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
481 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  24.58 
 
 
352 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  24.58 
 
 
352 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>