21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2084 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  100 
 
 		 135 aa  276  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4027  hypothetical protein  34.13 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.103767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5398  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.750575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 389 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  29.36 
 
 		 377 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  29.36 
 
 		 377 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  30 
 
 		 484 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1111  ATP-binding protein, putative  34.09 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 483 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 478 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 519 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0008  divergent AAA region  33.33 
 
 		 412 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 346 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 		 412 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3426  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  41.67 
 
 		 470 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0712  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 381 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.852525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 423 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>