More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0892 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  90.84 
 
 		 131 aa  234  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  55.88 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  49.44 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  43.01 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  42.39 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  44.94 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.78 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.68 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  49.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  49.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  48.05 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  48.1 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  49.3 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  41.11 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.84 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  40.91 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  37.08 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  46.75 
 
 		 101 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 		 98 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.53 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  46.97 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  39.29 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  46.75 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>