149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3166 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3166  griselysin  100 
 
 
527 aa  1069    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  41.55 
 
 
565 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  41.55 
 
 
565 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  41.37 
 
 
565 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  43.52 
 
 
565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  43.52 
 
 
565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  43.52 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  43.52 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  43.52 
 
 
565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  43.52 
 
 
585 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  44.59 
 
 
565 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  40.35 
 
 
565 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  39.65 
 
 
565 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  39.44 
 
 
565 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  41.42 
 
 
532 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  40.25 
 
 
1131 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  37.19 
 
 
1077 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  37.84 
 
 
947 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.84 
 
 
1147 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  34.31 
 
 
566 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.98 
 
 
727 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  36.13 
 
 
884 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  50.84 
 
 
221 aa  223  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  34.11 
 
 
566 aa  223  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  34.13 
 
 
565 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  34.5 
 
 
566 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  33.92 
 
 
566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  33.72 
 
 
566 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  35.41 
 
 
546 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  36.44 
 
 
802 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  31.97 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  31.97 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  31.77 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  32.36 
 
 
566 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  32.36 
 
 
566 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  31.82 
 
 
984 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  32.79 
 
 
924 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2479  peptidase M4 thermolysin  34.03 
 
 
508 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  38.5 
 
 
1154 aa  196  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  30.3 
 
 
554 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  30.3 
 
 
549 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  30.26 
 
 
591 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  29.98 
 
 
552 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  29.98 
 
 
547 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  29.94 
 
 
591 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  29.76 
 
 
554 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  29.57 
 
 
591 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  29.94 
 
 
549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  29.18 
 
 
556 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  34.9 
 
 
500 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  30.04 
 
 
478 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  32.95 
 
 
485 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  32 
 
 
759 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  34.44 
 
 
500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  33.19 
 
 
500 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  28.52 
 
 
509 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  28.52 
 
 
509 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  32.23 
 
 
701 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  31.63 
 
 
499 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  29.76 
 
 
556 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  28.78 
 
 
543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  28.78 
 
 
543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  31.43 
 
 
791 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  29.89 
 
 
556 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  27.98 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  29.15 
 
 
556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  34.45 
 
 
775 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  26.98 
 
 
507 aa  161  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  35.9 
 
 
498 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  35.26 
 
 
498 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  30.64 
 
 
777 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  31.59 
 
 
778 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  25.3 
 
 
558 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  30.8 
 
 
780 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  31.35 
 
 
778 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  31.59 
 
 
778 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  31.35 
 
 
778 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  30.21 
 
 
609 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  31.26 
 
 
774 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  25.13 
 
 
558 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  28.49 
 
 
1031 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  28.49 
 
 
565 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  28.3 
 
 
565 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  28.3 
 
 
565 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  36.55 
 
 
342 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  27.92 
 
 
565 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  29.43 
 
 
567 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  28.3 
 
 
565 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  34.16 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  29.25 
 
 
567 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  27.92 
 
 
568 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  27.92 
 
 
565 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  28.2 
 
 
567 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  28.31 
 
 
567 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.57 
 
 
567 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  36.65 
 
 
351 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  26.74 
 
 
891 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.57 
 
 
567 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  33.12 
 
 
1250 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  35.31 
 
 
350 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>