53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2067 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 215 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.4 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.8 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.71 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  36.59 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  33.98 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.75 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.27 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.76 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.27 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.27 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.27 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  38.27 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.24 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  38.27 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  34 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.71 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.43 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.45 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.86 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.59 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.33 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.99 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  34 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.5 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.56 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.21 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  36.5 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.16 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.46 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.86 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.67 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.87 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.14 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  27.84 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  27.84 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.65 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.39 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.76 
 
 		 245 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.76 
 
 		 245 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 216 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0854  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.59 
 
 		 177 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 		 410 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0759  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  38.24 
 
 		 301 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00372597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1002  CDP-diacylglycerol-serine O-phosphatidyltransferase  31.63 
 
 		 194 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0902  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.25 
 
 		 267 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.76 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  38.89 
 
 		 359 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>