More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1648 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
450 aa  899    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.78 
 
 
448 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  46.76 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.22 
 
 
448 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  41.1 
 
 
450 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.46 
 
 
448 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.31 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.59 
 
 
456 aa  342  5e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  37.8 
 
 
450 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  36.73 
 
 
455 aa  313  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.58 
 
 
449 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  41.7 
 
 
443 aa  309  8e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.96 
 
 
449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  37.58 
 
 
459 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  34.52 
 
 
449 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.14 
 
 
457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  36.26 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  35.54 
 
 
452 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  35.4 
 
 
451 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  34 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.34 
 
 
466 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  33.63 
 
 
451 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  32.6 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  35.86 
 
 
449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  35.49 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.9 
 
 
461 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  34.14 
 
 
452 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  32.89 
 
 
451 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  32.78 
 
 
435 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.65 
 
 
546 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.79 
 
 
466 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  33.92 
 
 
452 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  34.82 
 
 
461 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06231  glutathione reductase (NADPH)  31.66 
 
 
454 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  32.16 
 
 
451 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  32.38 
 
 
451 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  35.94 
 
 
461 aa  229  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  31.57 
 
 
451 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.58 
 
 
452 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  31.57 
 
 
451 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  34.23 
 
 
466 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  35.51 
 
 
451 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  31.35 
 
 
451 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  32.23 
 
 
451 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  33.7 
 
 
452 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 
453 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  32.16 
 
 
450 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  33.7 
 
 
451 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  35.84 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  36.03 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  33.48 
 
 
448 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  31.35 
 
 
451 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  31.79 
 
 
450 aa  226  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  33.03 
 
 
459 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  35.35 
 
 
452 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  34.82 
 
 
461 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  34.93 
 
 
452 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  31.79 
 
 
450 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.2 
 
 
466 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  35.84 
 
 
451 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  35.49 
 
 
460 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.14 
 
 
453 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  31.79 
 
 
450 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  32.16 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  35.78 
 
 
465 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  33.71 
 
 
550 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  31.94 
 
 
451 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  31.35 
 
 
451 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  35.81 
 
 
453 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  32.45 
 
 
451 aa  223  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  35.62 
 
 
451 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  33.93 
 
 
446 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  33.85 
 
 
449 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  35.62 
 
 
451 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  33.48 
 
 
464 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  36.06 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  32.88 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  34.53 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  34.14 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  34.08 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  33.92 
 
 
459 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05931  glutathione reductase (NADPH)  31.59 
 
 
454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.351259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  35.62 
 
 
448 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  35.4 
 
 
461 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  34.44 
 
 
451 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  31.94 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  34.3 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  34.3 
 
 
451 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>