214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2132 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
226 aa  460  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.84 
 
 
258 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  46.02 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.54 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.69 
 
 
250 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.44 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44 
 
 
269 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.61 
 
 
258 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.61 
 
 
263 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.61 
 
 
263 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.17 
 
 
278 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.65 
 
 
292 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.91 
 
 
287 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.67 
 
 
285 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.6 
 
 
271 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.04 
 
 
271 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.22 
 
 
285 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  41.89 
 
 
338 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.95 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.89 
 
 
338 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 
264 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.52 
 
 
1153 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
255 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.52 
 
 
299 aa  132  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.6 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.07 
 
 
242 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.55 
 
 
261 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  39.04 
 
 
277 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.13 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.22 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.31 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.82 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 
837 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 
328 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 
808 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 
328 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.09 
 
 
240 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.83 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.39 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  39.01 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.01 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.33 
 
 
283 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  35.32 
 
 
245 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.19 
 
 
266 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 
265 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.34 
 
 
257 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
231 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.62 
 
 
247 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 
230 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.65 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.28 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.36 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
252 aa  84.7  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  29.64 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.47 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
243 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  32.93 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.7 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.83 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.83 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  29.71 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  37.57 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.93 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.08 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.08 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.02 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  26.56 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  26.86 
 
 
302 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  25.94 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
271 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.75 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  33.04 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  32.61 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>