More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1223 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  355  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  46.67 
 
 
160 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  45.95 
 
 
155 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  45.95 
 
 
155 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  45.27 
 
 
155 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  45.27 
 
 
155 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  49.59 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  41.51 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  44.68 
 
 
155 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  46.46 
 
 
189 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  43.97 
 
 
160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  46.15 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  38.99 
 
 
171 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  43.48 
 
 
155 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  46.34 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  43.48 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  42.52 
 
 
172 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
174 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  35.8 
 
 
172 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  39.71 
 
 
182 aa  121  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  44.63 
 
 
173 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  35.33 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  37.28 
 
 
194 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  42.98 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  34.31 
 
 
173 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  34.55 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  39.83 
 
 
158 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.72 
 
 
168 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  39.67 
 
 
160 aa  104  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
167 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  35.15 
 
 
180 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  33.56 
 
 
182 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28.16 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.5 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.59 
 
 
173 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  27.59 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  34.38 
 
 
178 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.78 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.78 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  34.38 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.59 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.8 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  28.78 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.59 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.06 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.37 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  31.88 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  29.38 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.8 
 
 
437 aa  94.4  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.17 
 
 
185 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  29.6 
 
 
174 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.29 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
280 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.8 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.29 
 
 
422 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.61 
 
 
228 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
178 aa  88.2  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
169 aa  88.2  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.72 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  39.02 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.61 
 
 
196 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  37.4 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  28.29 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.33 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.8 
 
 
609 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.83 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
446 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  29.19 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
170 aa  84.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  37.4 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.22 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.22 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  30.67 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.77 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  36.8 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  35.45 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.9 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  32.41 
 
 
155 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.9 
 
 
433 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.85 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  38.68 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.32 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  32 
 
 
591 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  28.8 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  32 
 
 
589 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  31.43 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  27.49 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0399  cytochrome c-type biogenesis protein G  32.21 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
447 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  30.83 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.83 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  31.75 
 
 
622 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.97 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>