225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0950 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 467 aa  963    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  43.47 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  41.41 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  35.15 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  35.89 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  29.32 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  25.43 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  29.62 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  28.81 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  28.95 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  27.36 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  28.69 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  28.95 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  27.99 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  27.99 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  28.78 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  29.03 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  26.28 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  27.08 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  23.71 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  28.02 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  26.83 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  28.23 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  27.32 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  25.76 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  34.07 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  32.61 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  25.71 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.12 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  34.07 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  26.21 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  37.65 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  34.57 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  36.51 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  31.91 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.08 
 
 		 438 aa  50.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  37.36 
 
 		 496 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  26.51 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  24.83 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  24.83 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  32.18 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  26.21 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  27.37 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  26.21 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  26.21 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  37.29 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  26.21 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  34.57 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  36.51 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  35.59 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  34.52 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  29.81 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.27 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  35.8 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1548  GTP-binding protein EngA  38.1 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  28.95 
 
 		 459 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  31.18 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  31.18 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  32.97 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  34.92 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  29.46 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  30.68 
 
 		 498 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  34.92 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1436  GTP-binding protein EngA  34.92 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  25.52 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  28.87 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  34.92 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  28.21 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  25.52 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>