42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0511 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 462 aa  886    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  58.48 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  59.82 
 
 		 454 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  61.26 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  62.53 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  63.98 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  59.56 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  59.78 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  59.96 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  58.04 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  59.11 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  58.61 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  62.08 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.25 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  46.93 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  36.96 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  40.87 
 
 		 538 aa  263  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  41 
 
 		 524 aa  259  7e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  39.91 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  28.13 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  28.41 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  34.59 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  25.14 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  27.15 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  31.9 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  46.58 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 992 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 992 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  26.97 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  41.67 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  30.92 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  40.54 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  34.31 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  30.37 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  30.92 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3618  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.67 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.67 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  30.92 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  25.6 
 
 		 945 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  42.25 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  42.86 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>