26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1120 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1073    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  90.37 
 
 		 538 aa  860    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  73.59 
 
 		 520 aa  697    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  38.65 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  42.67 
 
 		 462 aa  286  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  41.98 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  43.06 
 
 		 455 aa  263  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  43.53 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  43.04 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  42.08 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  43.7 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  34.99 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  43.26 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  43.23 
 
 		 461 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  42.89 
 
 		 459 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  42.64 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  41 
 
 		 462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  42.49 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  32.83 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  25.82 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  26.35 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  29.15 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  23.9 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  24.26 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  33.73 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  40.91 
 
 		 466 aa  43.5  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>