28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5134 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  80.22 
 
 		 462 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  97.36 
 
 		 454 aa  778    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  895    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  99.56 
 
 		 454 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  94.71 
 
 		 454 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  83.52 
 
 		 461 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  79.25 
 
 		 462 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  77.97 
 
 		 455 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  76.46 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  76.89 
 
 		 459 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  75.77 
 
 		 458 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  60.66 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  60.22 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  46.45 
 
 		 473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.86 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  44 
 
 		 520 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  37.65 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  42.74 
 
 		 538 aa  279  9e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  42.68 
 
 		 524 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  28.74 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  29.02 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  33.03 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  24.46 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  27.09 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  35.96 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  40 
 
 		 157 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  36.49 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  45.31 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>