28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1439 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  996    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  27.27 
 
 		 454 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  26.12 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2063  hypothetical protein  29.82 
 
 		 854 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  33.73 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  31.75 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  32.93 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  36.31 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  37.74 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  36.31 
 
 		 456 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  30.43 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  28.97 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  33.71 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  23.72 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  26.91 
 
 		 311 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 		 312 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  31.9 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  28.16 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  29.46 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  27.68 
 
 		 447 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 299 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 299 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  20.92 
 
 		 299 aa  44.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.03 
 
 		 629 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  30.55 
 
 		 462 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  23.81 
 
 		 299 aa  43.5  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  26.21 
 
 		 301 aa  43.5  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  30.87 
 
 		 421 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>