More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1654 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  100 
 
 
240 aa  495  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
257 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 
256 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
256 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  44.8 
 
 
256 aa  201  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.32 
 
 
256 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 
256 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
256 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 
256 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
256 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
256 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
256 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
260 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.46 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.24 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  41.18 
 
 
247 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.44 
 
 
258 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.44 
 
 
258 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
250 aa  175  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  37.5 
 
 
246 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  43.24 
 
 
262 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  40.76 
 
 
250 aa  174  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  37.1 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
250 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
249 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  36.55 
 
 
250 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  41.13 
 
 
259 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.46 
 
 
249 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  34.14 
 
 
250 aa  164  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  34.81 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  41.88 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  41.88 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
245 aa  161  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  35.59 
 
 
262 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  37.34 
 
 
251 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  38.89 
 
 
266 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  40 
 
 
257 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  35.95 
 
 
256 aa  158  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  37.04 
 
 
252 aa  158  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  36.05 
 
 
254 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.3 
 
 
257 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
245 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  35.18 
 
 
257 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
246 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
254 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  38.53 
 
 
254 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  39.91 
 
 
258 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  37.5 
 
 
288 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
261 aa  154  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  38.12 
 
 
258 aa  154  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
254 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  37.8 
 
 
254 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  38.14 
 
 
222 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  35.14 
 
 
267 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
249 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  34.71 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.18 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  34.69 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 
249 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
249 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  36.61 
 
 
240 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 
249 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  36.61 
 
 
240 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  37.96 
 
 
251 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.46 
 
 
271 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
254 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.89 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  35.9 
 
 
278 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.24 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  37.61 
 
 
249 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  38.25 
 
 
249 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
281 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  36.21 
 
 
245 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  32.78 
 
 
243 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 
254 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
230 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 
259 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  32.77 
 
 
249 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
249 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  34.29 
 
 
248 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  35.92 
 
 
257 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  32.92 
 
 
262 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  36.07 
 
 
251 aa  148  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.6 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  34.62 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  34.04 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  39.72 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  36.86 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  34.63 
 
 
298 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  36.75 
 
 
251 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>