More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1214 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
330 aa  675    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.82 
 
 
472 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.91 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.1 
 
 
353 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.25 
 
 
323 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 
327 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.02 
 
 
330 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
353 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.05 
 
 
340 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  34.88 
 
 
365 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  29.28 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 
340 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.97 
 
 
443 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  28.86 
 
 
356 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  30.33 
 
 
343 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.64 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.85 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.4 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  32.62 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  31.67 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
286 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.44 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  31.05 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.35 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  30.65 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.38 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.32 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.05 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.52 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  33.33 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  29.2 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.63 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  30.53 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  30.35 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
253 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30.93 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.54 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.81 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  27.07 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  28.09 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  29.94 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  30.81 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  32.98 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.02 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>