More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0670 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0670  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  100 
 
 		 330 aa  684    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  41.45 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  40.47 
 
 		 771 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  40.39 
 
 		 302 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  37.12 
 
 		 773 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  38.05 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  40.75 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  39.33 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  38.44 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  39.13 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  38.59 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  39.13 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  39.86 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  35.9 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  39 
 
 		 764 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  40.07 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  37.05 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  37.74 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  38.87 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.79 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  36.77 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  36.75 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  37.67 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  37.33 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  37.67 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  36.68 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  39.16 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.74 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  36.93 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  37.94 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  36.6 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  36.54 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  37.5 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  37.33 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  42.24 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  38.59 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  36.6 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  36.6 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  37.67 
 
 		 295 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  37.16 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  34.04 
 
 		 326 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  34.54 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  37.84 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  35.65 
 
 		 303 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  34.04 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  37.41 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  36 
 
 		 768 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  37.41 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  36.72 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  35.76 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  37.12 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  35.33 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  38.39 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  37.29 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  35.96 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  38.51 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  35.71 
 
 		 455 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  38.16 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  37.5 
 
 		 326 aa  178  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  40.27 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  35.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  37.13 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  35.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  35.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  36.64 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  38.11 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  35.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  35.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  35.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  38.11 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  38.11 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  38.11 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  36.3 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  36.54 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  37.46 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  36.77 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  35.97 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  35.74 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  35.71 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  42.68 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  34.2 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  35.1 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  35.74 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  37.37 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  37 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  37.2 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  34.74 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  35.74 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  37.46 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  36.05 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  40.33 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  38.18 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  34.7 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  36.27 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.28 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  38.59 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  36.8 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  36.09 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>