More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5110 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  100 
 
 		 142 aa  286  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  88.03 
 
 		 142 aa  257  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  80.99 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  75.89 
 
 		 143 aa  229  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  76.98 
 
 		 142 aa  219  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  70.21 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  72.54 
 
 		 144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  66.9 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 144 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  70.63 
 
 		 144 aa  207  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 143 aa  206  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 143 aa  204  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  204  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  66.2 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  69.93 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  67.83 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  200  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  71.32 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  66.2 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  186  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  62.77 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  61.97 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  65.12 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  178  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  57.97 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  57.97 
 
 		 140 aa  174  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  56.52 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 143 aa  173  8e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  57.97 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  55.47 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  55.47 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>