More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4221 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
346 aa  695    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  70.52 
 
 
346 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  69.65 
 
 
346 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.03 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  66.18 
 
 
346 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  62.22 
 
 
352 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  61.65 
 
 
354 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 
361 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
346 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.6 
 
 
346 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.21 
 
 
348 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.8 
 
 
367 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.36 
 
 
341 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
349 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.9 
 
 
346 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
345 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
343 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.12 
 
 
344 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.09 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.17 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.39 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.26 
 
 
341 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
345 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 
349 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
338 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 
342 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
342 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.83 
 
 
345 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.47 
 
 
356 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.32 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.75 
 
 
336 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.44 
 
 
366 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.93 
 
 
348 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
358 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.53 
 
 
350 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.53 
 
 
350 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.53 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.53 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.53 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.53 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.31 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.25 
 
 
350 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
350 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
350 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.99 
 
 
335 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
351 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
351 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
336 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 
365 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.12 
 
 
363 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.42 
 
 
356 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
336 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  31.05 
 
 
345 aa  156  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.59 
 
 
375 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
350 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.88 
 
 
374 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
321 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
369 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.42 
 
 
351 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.86 
 
 
344 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
358 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.23 
 
 
362 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.91 
 
 
357 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 
336 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
362 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.94 
 
 
362 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
362 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
343 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
340 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.58 
 
 
373 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
362 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.59 
 
 
338 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.49 
 
 
362 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
362 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  29.91 
 
 
344 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
373 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
335 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
336 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  30.77 
 
 
355 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
364 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.42 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.03 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 
325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  30.77 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.13 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.46 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  31.55 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>