239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3802 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  67.27 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  63.74 
 
 
171 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  64.07 
 
 
180 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  56.91 
 
 
210 aa  197  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  58.68 
 
 
203 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  61.21 
 
 
201 aa  188  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  63.4 
 
 
178 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  65.99 
 
 
174 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  60.69 
 
 
258 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  62.15 
 
 
170 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  63.09 
 
 
172 aa  184  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  63.09 
 
 
172 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  61.59 
 
 
175 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  56.97 
 
 
173 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  58.74 
 
 
236 aa  178  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  54.17 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  57.32 
 
 
241 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  59.63 
 
 
184 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  55.48 
 
 
208 aa  148  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  44.31 
 
 
211 aa  141  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  45.14 
 
 
211 aa  140  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  46.85 
 
 
220 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  43.75 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  44.94 
 
 
198 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  40.53 
 
 
222 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  30.63 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  37.3 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.25 
 
 
481 aa  64.3  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  36.99 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  32.43 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  35.62 
 
 
227 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  37.7 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  36.76 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  36.36 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  38.94 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  43.66 
 
 
239 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  37.84 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  36.04 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  34.15 
 
 
240 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  39.51 
 
 
247 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  38.27 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  46.43 
 
 
241 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  39.73 
 
 
249 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  35.9 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  41.79 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.29 
 
 
252 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  39.66 
 
 
262 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  37.04 
 
 
238 aa  56.6  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  36.99 
 
 
279 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  36.9 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  37.18 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  35.56 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  27.84 
 
 
206 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  36.9 
 
 
253 aa  55.1  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  36.9 
 
 
255 aa  55.1  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  31.54 
 
 
236 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  36.9 
 
 
251 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  55.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  41.82 
 
 
257 aa  55.1  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  35.19 
 
 
219 aa  54.7  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  42.37 
 
 
242 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  36.78 
 
 
278 aa  54.7  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  39.44 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  28.91 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  39.44 
 
 
256 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  42.11 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  28.79 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  35.19 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  32.43 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  35.63 
 
 
278 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  38.57 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  45.16 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  30.85 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  36 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  37.5 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  35.11 
 
 
246 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  25.36 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  31.17 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  38.16 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  35.11 
 
 
246 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  31.33 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  46.3 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  35.19 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  31.08 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
292 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  43.08 
 
 
286 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
292 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  39.44 
 
 
247 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  31.82 
 
 
226 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
223 aa  52  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  39.29 
 
 
249 aa  52  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  48 
 
 
242 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  42.62 
 
 
227 aa  52  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>