More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3713 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3487  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000245666  normal  0.022754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2583  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  hitchhiker  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3631  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00123736  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3600  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0391749  normal  0.108213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3713  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0391969  normal  0.214185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2560  Integrase catalytic region  100 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000211729  normal  0.0105372 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  28.88 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  29.48 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  29.48 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  25.35 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  26.75 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  25.35 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  25.35 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  27.38 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  34.75 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  27.66 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  30.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  30.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  30.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  30.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  30.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  28.46 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  28.9 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  26.7 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  26.7 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  27.43 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  27.99 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  26.29 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  25.73 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0353  transposase  33.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0103565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  26.14 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  26.14 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  29.25 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  29.25 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  26.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  26.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  26.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  26.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  26.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  26.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  26.14 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>