More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3110 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  72.43 
 
 		 185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  281  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  71.35 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  70.27 
 
 		 185 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  70.27 
 
 		 185 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  70.27 
 
 		 185 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  69.19 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  269  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  261  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  250  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  235  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 183 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  193  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>