More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0803 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
351 aa  695    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.88 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.73 
 
 
347 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.46 
 
 
339 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.19 
 
 
417 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  48.35 
 
 
370 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.3 
 
 
334 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.15 
 
 
365 aa  257  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.71 
 
 
359 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.94 
 
 
345 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.94 
 
 
345 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.94 
 
 
345 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.56 
 
 
345 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 
344 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.06 
 
 
356 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.36 
 
 
379 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.71 
 
 
357 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.72 
 
 
354 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.56 
 
 
344 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.77 
 
 
357 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.06 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.77 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
346 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.23 
 
 
357 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.42 
 
 
395 aa  222  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.06 
 
 
359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.71 
 
 
357 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  36.18 
 
 
352 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  35.88 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.77 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.55 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.86 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.51 
 
 
335 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.9 
 
 
355 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.33 
 
 
331 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
355 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
348 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.38 
 
 
336 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.81 
 
 
351 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
350 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.52 
 
 
351 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
343 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.81 
 
 
351 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
352 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
356 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.37 
 
 
350 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.52 
 
 
350 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.71 
 
 
351 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.82 
 
 
351 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.43 
 
 
351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.14 
 
 
351 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.14 
 
 
351 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.32 
 
 
356 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.14 
 
 
351 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.12 
 
 
346 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.67 
 
 
360 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6082  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.72 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
356 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.95 
 
 
347 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  34.01 
 
 
357 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
357 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.87 
 
 
350 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
355 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.72 
 
 
353 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
379 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06844  mitochondrial 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12790)  34.41 
 
 
505 aa  193  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.24 
 
 
376 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1954  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
349 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
379 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.14 
 
 
368 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.94 
 
 
363 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.75 
 
 
376 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
334 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 
350 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.48 
 
 
368 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
358 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.83 
 
 
363 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
370 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.18 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.83 
 
 
363 aa  189  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
353 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
365 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
379 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.97 
 
 
363 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.63 
 
 
414 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 
391 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.63 
 
 
369 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  34.1 
 
 
365 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
379 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
386 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.2 
 
 
444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4702  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.4 
 
 
387 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.18 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>