More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0159 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  100 
 
 
705 aa  1361    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  62.22 
 
 
673 aa  722    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  64.62 
 
 
657 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  60.3 
 
 
719 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  59.59 
 
 
674 aa  695    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  64.67 
 
 
674 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  60.25 
 
 
699 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  61.29 
 
 
653 aa  663    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  56.6 
 
 
680 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.38 
 
 
622 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.38 
 
 
622 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.38 
 
 
622 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.63 
 
 
688 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  51.39 
 
 
629 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  50.29 
 
 
638 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  40.4 
 
 
680 aa  489  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  44.93 
 
 
696 aa  482  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.43 
 
 
674 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  45.55 
 
 
637 aa  465  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  40.71 
 
 
669 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  69.39 
 
 
788 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  71.43 
 
 
713 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  71.51 
 
 
738 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  63.55 
 
 
616 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  41.49 
 
 
653 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  67.36 
 
 
776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  73.86 
 
 
730 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  39.09 
 
 
650 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  73.91 
 
 
690 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  55.91 
 
 
364 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  62.58 
 
 
626 aa  350  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  54.63 
 
 
364 aa  350  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  54.97 
 
 
346 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  48.62 
 
 
356 aa  345  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  54.33 
 
 
372 aa  340  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  61.03 
 
 
618 aa  338  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.29 
 
 
374 aa  337  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  54.38 
 
 
351 aa  333  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.85 
 
 
373 aa  329  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  50.15 
 
 
337 aa  327  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.87 
 
 
337 aa  325  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.03 
 
 
405 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.57 
 
 
364 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  53.64 
 
 
347 aa  323  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.46 
 
 
394 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.17 
 
 
362 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.45 
 
 
362 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  51.54 
 
 
346 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.45 
 
 
362 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.84 
 
 
358 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.84 
 
 
358 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
362 aa  319  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.09 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  52.04 
 
 
334 aa  316  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.76 
 
 
357 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.73 
 
 
336 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.35 
 
 
337 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.45 
 
 
362 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.25 
 
 
340 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.52 
 
 
362 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.52 
 
 
362 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.97 
 
 
391 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.94 
 
 
340 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.38 
 
 
362 aa  313  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.54 
 
 
384 aa  313  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.52 
 
 
362 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.45 
 
 
369 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.24 
 
 
363 aa  312  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.11 
 
 
337 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  50.74 
 
 
365 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.11 
 
 
337 aa  311  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.67 
 
 
386 aa  310  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  50.93 
 
 
345 aa  309  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.04 
 
 
383 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.58 
 
 
379 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.96 
 
 
370 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.18 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  51.55 
 
 
334 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  51.88 
 
 
334 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  51.55 
 
 
334 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  48.59 
 
 
397 aa  302  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.71 
 
 
341 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.7 
 
 
340 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.76 
 
 
383 aa  301  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.7 
 
 
340 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  41.88 
 
 
614 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.97 
 
 
600 aa  298  3e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.92 
 
 
368 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.21 
 
 
386 aa  293  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.46 
 
 
348 aa  293  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.64 
 
 
665 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.99 
 
 
341 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  43.75 
 
 
637 aa  286  8e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  43.75 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  51.1 
 
 
660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.63 
 
 
725 aa  285  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  45.51 
 
 
443 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  51.44 
 
 
689 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  53.16 
 
 
670 aa  279  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  46.53 
 
 
749 aa  279  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>