More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0056 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  100 
 
 		 470 aa  973    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  62.94 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  62.23 
 
 		 461 aa  596  1e-169  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  62.66 
 
 		 461 aa  592  1e-168  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  59.22 
 
 		 463 aa  567  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  58.58 
 
 		 544 aa  558  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 482 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  57.17 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  58.01 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  58.01 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  57.52 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  56.62 
 
 		 462 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  57.7 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 459 aa  541  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  57.73 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  56.64 
 
 		 465 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 478 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  58.26 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  55.51 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  55.53 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  55.1 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  55.31 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 466 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  55.95 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  54.09 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  57.67 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  54.31 
 
 		 472 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  56.24 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 471 aa  525  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  55.31 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 468 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 467 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  55.7 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 631 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  53.8 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  53.58 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  54.09 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  54.59 
 
 		 467 aa  512  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5517  fumarate hydratase  54.1 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985388  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 462 aa  511  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  53.71 
 
 		 469 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  54.59 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  54.98 
 
 		 462 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  55 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  54.92 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  54.92 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  55.27 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  53.65 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  53.55 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>