More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02771 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 131 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  99.24 
 
 		 131 aa  239  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  83.21 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  87.88 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  81.68 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  84.73 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  63.91 
 
 		 129 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  59.85 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  59.85 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  61.83 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  58.65 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  46.56 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  46.56 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  53.38 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.04 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  54.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  58.02 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 128 aa  95.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  53.44 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  46.72 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  53.08 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  52.07 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  53.85 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  42.75 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  54.69 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 126 aa  85.9  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  50.38 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  50.38 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3447  ribosomal protein L7/L12  46.56 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00096763  hitchhiker  0.00626302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  46.51 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>