More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4734 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4734  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
303 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
303 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  40.1 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  44.1 
 
 
303 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
306 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  43.46 
 
 
330 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  40.1 
 
 
320 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
300 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  37.56 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  37.57 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  36.32 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
296 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  37.57 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  36.46 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
300 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 
296 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
329 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
305 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  40.84 
 
 
298 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
296 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  34.53 
 
 
297 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  35.87 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  35.87 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.18 
 
 
299 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.22 
 
 
301 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  39.9 
 
 
299 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  39.9 
 
 
299 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  39.9 
 
 
299 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  39.9 
 
 
299 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  39.9 
 
 
299 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  31.64 
 
 
297 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  34.9 
 
 
305 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
301 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
299 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  34.9 
 
 
305 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  34.9 
 
 
305 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.66 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  40.1 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.1 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  40.1 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  38.42 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  40.1 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  34.38 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  38.42 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  40.1 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 
297 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0727  transcriptional regulator  35.34 
 
 
309 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.849989  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 
296 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
305 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.85 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>