More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3936 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3613  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.01 
 
 
273 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.01 
 
 
273 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  90.64 
 
 
273 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4157  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.37 
 
 
275 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4569  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.9 
 
 
277 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572506  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6258  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.09 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.434452  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6335  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
266 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.92 
 
 
261 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  37.31 
 
 
261 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.54 
 
 
261 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.54 
 
 
261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.54 
 
 
261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  36.15 
 
 
261 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
257 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  37.69 
 
 
261 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
797 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.5 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  34.5 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  34.5 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  34.5 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.5 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.5 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  34.5 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  37.7 
 
 
240 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
259 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.69 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
265 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
265 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.3 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
266 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 
262 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
262 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  35 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  28 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  26.91 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.71 
 
 
657 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
256 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
260 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  34.77 
 
 
262 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.24 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  32.42 
 
 
264 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  30.8 
 
 
289 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.34 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.34 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.92 
 
 
663 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.89 
 
 
657 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
271 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.34 
 
 
257 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2162  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
258 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308947  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 
257 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 
257 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.76 
 
 
258 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.5 
 
 
259 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
262 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>