69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3110 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  100 
 
 
768 aa  1544    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  61.79 
 
 
410 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  62.11 
 
 
432 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  33.45 
 
 
783 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  44.77 
 
 
411 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  38.24 
 
 
421 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3114  hypothetical protein  36.99 
 
 
471 aa  170  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138557  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  44.49 
 
 
391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
469 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  41.23 
 
 
401 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2962  hypothetical protein  39.89 
 
 
488 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0278678  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3381  hypothetical protein  34.12 
 
 
433 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  37.57 
 
 
307 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  37.57 
 
 
307 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  37.57 
 
 
307 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  32.88 
 
 
898 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.53 
 
 
499 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  32.11 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  32.11 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  32.11 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  33.49 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  29.26 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  32.28 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  32.28 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  33.15 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  29.29 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  33.15 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  27.45 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  31.61 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  32.6 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  29.83 
 
 
517 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  32.4 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  30 
 
 
580 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  32.68 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  30.29 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  28.12 
 
 
655 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  29.6 
 
 
526 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  27.04 
 
 
413 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  27.04 
 
 
433 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  27.04 
 
 
433 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  26.15 
 
 
396 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  31.34 
 
 
542 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  31.34 
 
 
542 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  31.34 
 
 
542 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  26.83 
 
 
529 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  26.83 
 
 
529 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  28.07 
 
 
533 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  30.59 
 
 
448 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  33.17 
 
 
416 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  32.58 
 
 
588 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  37.5 
 
 
404 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  27.69 
 
 
388 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  25.94 
 
 
527 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  29.89 
 
 
431 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  31.5 
 
 
458 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  30.12 
 
 
494 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  31.05 
 
 
433 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  29.08 
 
 
377 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  29.08 
 
 
377 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  29.08 
 
 
377 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  29.28 
 
 
533 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  30.1 
 
 
380 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  27.4 
 
 
518 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  27.94 
 
 
409 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  36.61 
 
 
359 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  24.57 
 
 
461 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  25.12 
 
 
468 aa  46.2  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  27.46 
 
 
437 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>