55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3103 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  820    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  63.42 
 
 
435 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  49.64 
 
 
423 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  55.63 
 
 
431 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  45.54 
 
 
409 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  53.9 
 
 
448 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  34.27 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  32.75 
 
 
307 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  34.92 
 
 
380 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  32.75 
 
 
307 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  32.75 
 
 
307 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  32.65 
 
 
377 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  32.65 
 
 
377 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  32.65 
 
 
377 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  37.22 
 
 
401 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  33.18 
 
 
404 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  33.18 
 
 
416 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  29.39 
 
 
528 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  33.05 
 
 
359 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  29.33 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  38.64 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  33.9 
 
 
768 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  28.38 
 
 
580 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  27.97 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  29.65 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.02 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  28.57 
 
 
655 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  26.65 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  27.74 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  28.82 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  32.69 
 
 
540 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  28.52 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  28.52 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  28.81 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  29.55 
 
 
588 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  29.91 
 
 
499 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  24.32 
 
 
783 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  36.44 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  36.44 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  34.76 
 
 
433 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  23.53 
 
 
527 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  27.8 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  28.95 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  25.93 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  24.32 
 
 
502 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  25.3 
 
 
526 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  26.34 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  24.31 
 
 
529 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  24.31 
 
 
529 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  26.83 
 
 
517 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  26.83 
 
 
517 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  26.83 
 
 
517 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  27.23 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  25 
 
 
517 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>