More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2897 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53721  normal  0.207776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0326  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.4 
 
 
279 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.4 
 
 
279 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.4 
 
 
279 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.37 
 
 
281 aa  346  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312689  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.61 
 
 
281 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.77 
 
 
288 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  40.7 
 
 
259 aa  175  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
273 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
258 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4896  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
255 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0462854  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
256 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  40.7 
 
 
267 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1147  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
295 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  37.88 
 
 
263 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
259 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
258 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  28.2 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  28.2 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  28.2 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
240 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0504  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.95 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.819971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  28.79 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  31 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.685606  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.08 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.1 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.1 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  28.24 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  28.68 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.52 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  27.24 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  26.64 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  26.64 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  26.64 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2492  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.44 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.38 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
240 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5000  dehydrogenases with different specificities-like protein  36.21 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.456323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  35.97 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.62 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06655  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03520)  33.33 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.27 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865732  hitchhiker  0.000720123 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0445415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2297  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844738  decreased coverage  0.0000370278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.01 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  decreased coverage  0.00119468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.550074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  30.11 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  29.64 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  32.03 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2405  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.73 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0129  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.68 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  27.51 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  27.08 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  27.74 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0325  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.91 
 
 
243 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  28.96 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
249 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1840  glucose 1-dehydrogenase  36.45 
 
 
266 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.473951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>