60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1838 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  68.9 
 
 
423 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  63.46 
 
 
413 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  51.03 
 
 
448 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  61.76 
 
 
409 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  59.73 
 
 
431 aa  322  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  38.33 
 
 
307 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  38.33 
 
 
307 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  38.33 
 
 
307 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  43.01 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  35.14 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  35.59 
 
 
416 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  33.2 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  33.2 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  33.2 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  32.65 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  31.91 
 
 
359 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  29.44 
 
 
528 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  30.59 
 
 
391 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  31.25 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  38.85 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  32.4 
 
 
768 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  31.03 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  29.46 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  29.46 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  29.46 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  26.58 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  31.98 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  29.77 
 
 
655 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  27.9 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  33.92 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  30.06 
 
 
540 aa  63.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  30 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
469 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  29.56 
 
 
533 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  28.88 
 
 
421 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  31.06 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  31.06 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  29.35 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  27.95 
 
 
527 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.11 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  25.48 
 
 
542 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  25.48 
 
 
542 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  26.09 
 
 
502 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  25.48 
 
 
542 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  24.44 
 
 
783 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  40 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  40 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  28.48 
 
 
396 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.07 
 
 
526 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  29.17 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  34.23 
 
 
517 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  24.52 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  24.52 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  24.81 
 
 
517 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  26.97 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  27.96 
 
 
533 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  25.79 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  24.26 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>