33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0239 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  68.18 
 
 
132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  63.64 
 
 
141 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  63.64 
 
 
141 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  63.64 
 
 
141 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  60.45 
 
 
282 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  57.14 
 
 
146 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  54.96 
 
 
286 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  52 
 
 
129 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  33.82 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  34.13 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  34.13 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  34.13 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  34.38 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  33.59 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
288 aa  67  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  26.98 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  28.03 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  26.19 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  32.17 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  25.2 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  25.2 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  35.16 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  35.16 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  31.01 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  28.21 
 
 
154 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  25.19 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  25.2 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  28.79 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46080  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.819422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3919  hypothetical protein  29.29 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>