More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2349 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
616 aa  1233    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
626 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  57.66 
 
 
611 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  54.79 
 
 
698 aa  287  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  57.31 
 
 
609 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  56.52 
 
 
615 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 
427 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  41.69 
 
 
424 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  41.61 
 
 
423 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  35.13 
 
 
668 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
668 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  36.09 
 
 
583 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
721 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  36.9 
 
 
701 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.9 
 
 
604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.74 
 
 
645 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.69 
 
 
647 aa  137  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  35.97 
 
 
618 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.94 
 
 
700 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.83 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  35.35 
 
 
586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.5 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.29 
 
 
843 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.45 
 
 
584 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  42.03 
 
 
646 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
862 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  32.85 
 
 
692 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
612 aa  130  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.58 
 
 
632 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  32.97 
 
 
609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.23 
 
 
586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.85 
 
 
728 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
691 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.99 
 
 
593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
763 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.46 
 
 
621 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
641 aa  127  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
444 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.53 
 
 
676 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
316 aa  127  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
985 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.05 
 
 
664 aa  127  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 
653 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.4 
 
 
613 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
568 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 
575 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  34.55 
 
 
625 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
407 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.07 
 
 
627 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.81 
 
 
591 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
622 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
624 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
1422 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
624 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
624 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  34.3 
 
 
668 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.53 
 
 
681 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
513 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  34.2 
 
 
667 aa  124  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  34.55 
 
 
625 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.63 
 
 
527 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.73 
 
 
650 aa  124  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
663 aa  124  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.01 
 
 
715 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.42 
 
 
403 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  33.21 
 
 
597 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.67 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  33.57 
 
 
661 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  33 
 
 
445 aa  123  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
604 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 
662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.84 
 
 
693 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5499  serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
651 aa  121  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 
559 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 
552 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.47 
 
 
653 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0023  protein kinase  37.9 
 
 
481 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.84 
 
 
642 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.16 
 
 
613 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
646 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 
1289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
642 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
695 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.3 
 
 
601 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
528 aa  120  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
614 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.74 
 
 
614 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>