25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2276 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  47.88 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  26.35 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  28.22 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  25.79 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  27.95 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  23.3 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  23.56 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>